Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 199 (cutoff=0.5 Å)
Cluster size 222 structure(s)
Representative structure 1fka:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NN
Cluster members
AA
1vs6:B, 1022-1025, 1vs8:B, 1022-1025, 2aw4:B, 1022-1025, 2awb:B, 1022-1025, 2i2t:B, 1022-1025, 2i2v:B, 1022-1025, 2j28:B, 1022-1025, 2qam:B, 1022-1025, 2qao:B, 1022-1025, 2qba:B, 1022-1025, 2qbc:B, 1022-1025, 2qbe:B, 1022-1025, 2qbg:B, 1022-1025, 2qbi:B, 1022-1025, 2qbk:B, 1022-1025, 2qov:B, 1022-1025, 2qox:B, 1022-1025, 2qoz:B, 1022-1025, 2qp1:B, 1022-1025, 2z4l:B, 1022-1025, 2z4n:B, 1022-1025, 3bbx:B, 1100-1103, 3df2:B, 1022-1025, 3df4:B, 1022-1025
AC
1ffk:0, 1397-1400, 1jid:B, 22-25, 1jj2:0, 1444-1447, 1k73:A, 1444-1447, 1k8a:A, 1444-1447, 1k9m:A, 1444-1447, 1kc8:A, 1444-1447, 1kd1:A, 1444-1447, 1kqs:0, 1444-1447, 1l1w:A, 4-7, 1l9a:B, 45-48, 1m1k:A, 1444-1447, 1m90:A, 1444-1447, 1mfq:A, 27-30, 1mfq:A, 45-48, 1n8r:A, 1444-1447, 1nji:A, 1444-1447, 1q7y:A, 1444-1447, 1q81:A, 1444-1447, 1q82:A, 1444-1447, 1q86:A, 1444-1447, 1qvf:0, 1444-1447, 1qvg:0, 1444-1447, 1ry1:A, 27-30, 1ry1:A, 45-48, 1s1i:3, 1555-1558, 1s72:0, 1444-1447, 1vq4:0, 1444-1447, 1vq5:0, 1444-1447, 1vq5:0, 588-591, 1vq6:0, 1444-1447, 1vq7:0, 1444-1447, 1vq8:0, 1444-1447, 1vq9:0, 1444-1447, 1vqk:0, 1444-1447, 1vql:0, 1444-1447, 1vqm:0, 1444-1447, 1vqn:0, 1444-1447, 1vqo:0, 1444-1447, 1vqp:0, 1444-1447, 1w2b:0, 1444-1447, 1yhq:0, 1444-1447, 1yi2:0, 1444-1447, 1yij:0, 1444-1447, 1yit:0, 1444-1447, 1yj9:0, 1444-1447, 1yjn:0, 1444-1447, 1yjw:0, 1444-1447, 2go5:A, 27-30, 2go5:A, 45-48, 2j37:A, 27-30, 2j37:A, 45-48, 2j37:Z, 142-145, 2o44:A, 1661-1664, 2o45:A, 2469-2472, 2otj:0, 1444-1447, 2otl:0, 1444-1447, 2qa4:0, 1449-1452, 2qex:0, 1444-1447, 3cc2:0, 1444-1447, 3cc4:0, 1444-1447, 3cc7:0, 1444-1447, 3cce:0, 1444-1447, 3ccj:0, 1444-1447, 3ccj:0, 588-591, 3ccl:0, 1444-1447, 3ccm:0, 1444-1447, 3ccq:0, 1444-1447, 3ccr:0, 1444-1447, 3ccs:0, 1444-1447, 3ccu:0, 1444-1447, 3ccv:0, 1444-1447, 3cd6:0, 1444-1447, 3cma:0, 1444-1447, 3cme:0, 1444-1447, 3cpw:0, 1444-1447
AG
1njm:0, 1175-1178, 1njn:0, 1175-1178, 1njo:0, 1175-1178, 1njp:0, 1175-1178, 1pnu:0, 1191-1194, 1pny:0, 1191-1194, 1sm1:0, 1175-1178, 2es5:A, 4-7, 2hgj:A, 2070-2073, 3epk:F, 61-64
AU
2gya:9, 88-91
CA
1i97:A, 1392-1395, 1u6p:B, 76-79, 1xbp:0, 1147-1150, 2b64:A, 327-330, 2o44:A, 813-816, 2vhm:A, 112-115, 2vhm:B, 691-694, 2vhn:B, 691-694, 2zjp:X, 791-794, 2zjq:X, 791-794, 2zjr:X, 791-794, 3cf5:X, 791-794, 3dll:X, 791-794
CC
1fka:A, 1281-1284, 1u6b:B, 149-152, 1zzn:B, 149-152, 3bo2:B, 149-152, 3bo3:B, 149-152, 3bo4:B, 149-152
CG
1j5a:A, 1359-1362, 1jzx:A, 1359-1362, 1jzy:A, 1359-1362, 1jzz:A, 1359-1362, 1k01:A, 1359-1362, 1njm:0, 1351-1354, 1njn:0, 1351-1354, 1njo:0, 1351-1354, 1njp:0, 1351-1354, 1nkw:0, 1351-1354, 1nwx:0, 1351-1354, 1nwy:0, 1351-1354, 1ond:0, 1351-1354, 1pnu:0, 1367-1370, 1pny:0, 1367-1370, 1y69:0, 1065-1068, 2ogm:0, 36-39, 2ogn:0, 1351-1354, 2v47:A, 1070-1073, 2v49:A, 1070-1073, 3d5b:A, 1214-1217, 3d5d:A, 1214-1217
GA
2v3c:M, 10-13
GC
3d5a:A, 68-71, 3d5c:A, 68-71
GG
1fjg:A, 719-722, 1fka:A, 1267-1270, 1i95:A, 722-725, 1i96:A, 722-725, 1n33:A, 719-722, 1n34:A, 719-722, 1xnq:A, 719-722, 1xnr:A, 719-722, 1yl3:A, 1777-1780, 1yl4:A, 719-722, 2hgr:A, 719-722, 2uua:A, 719-722, 2uub:A, 719-722, 2uuc:A, 719-722, 2uxc:A, 719-722, 2v47:A, 1111-1114, 2v49:A, 1111-1114
GU
1yl4:A, 1038-1041, 2b66:A, 2100-2103, 2b9n:A, 2100-2103, 2b9p:A, 2100-2103, 2o44:A, 1670-1673, 2qux:C, 20-23, 3bbo:A, 2356-2359
UC
1t28:A, 2-5, 1yl3:A, 2673-2676, 2gip:A, 5-8, 2gy9:A, 622-625, 2gyb:A, 622-625
UG
1j5a:A, 2010-2013, 1jzx:A, 2010-2013, 1jzy:A, 2010-2013, 1jzz:A, 2010-2013, 1k01:A, 2010-2013, 1k9m:A, 969-972, 1kc8:A, 969-972, 1kd1:A, 969-972, 1kqs:0, 969-972, 1n8r:A, 969-972, 1nkw:0, 2002-2005, 1nwx:0, 2002-2005, 1nwy:0, 2002-2005, 1q82:A, 969-972, 1qvf:0, 969-972, 1qvg:0, 969-972, 1sm1:0, 2002-2005, 1w2b:0, 969-972, 1xbp:0, 1190-1193, 1z58:2, 509-512, 2gyb:A, 911-914, 2otj:0, 969-972, 2qex:0, 969-972, 2vhm:A, 3-6, 3cme:0, 969-972
UU
1j5a:A, 2131-2134, 1jzx:A, 2131-2134, 1jzy:A, 2131-2134, 1jzz:A, 2131-2134, 1k01:A, 2131-2134, 1nkw:0, 2123-2126, 1nwx:0, 2123-2126, 1nwy:0, 2123-2126, 1sm1:0, 2123-2126, 2rkj:C, 154-157, 2rkj:G, 154-157, 2rkj:K, 154-157, 2rkj:O, 154-157