Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(001)-Segment cluster 3049 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 574 structure(s)
Representative structure 1vsa:w (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence N
Cluster members
A
1c2w:B, 2004-2006, 1c2w:B, 2081-2083, 1fjg:A, 132-134, 1fjg:A, 305-307, 1fjg:A, 711-713, 1hnw:A, 132-134, 1hnw:A, 305-307, 1hnw:A, 711-713, 1hnx:A, 132-134, 1hnx:A, 305-307, 1hnx:A, 711-713, 1hnz:A, 132-134, 1hnz:A, 305-307, 1hnz:A, 711-713, 1hr0:A, 132-134, 1hr0:A, 305-307, 1hr0:A, 711-713, 1i94:A, 135-137, 1i94:A, 308-310, 1i94:A, 714-716, 1i95:A, 135-137, 1i95:A, 714-716, 1i96:A, 135-137, 1i96:A, 714-716, 1ibk:A, 132-134, 1ibk:A, 305-307, 1ibk:A, 711-713, 1ibl:A, 132-134, 1ibl:A, 305-307, 1ibl:A, 711-713, 1ibm:A, 132-134, 1ibm:A, 305-307, 1ibm:A, 711-713, 1j5e:A, 132-134, 1j5e:A, 305-307, 1j5e:A, 711-713, 1n32:A, 132-134, 1n32:A, 305-307, 1n32:A, 711-713, 1n33:A, 132-134, 1n33:A, 305-307, 1n33:A, 711-713, 1n34:A, 132-134, 1n34:A, 305-307, 1n34:A, 711-713, 1n36:A, 132-134, 1n36:A, 305-307, 1n36:A, 711-713, 1nwx:0, 2293-2295, 1nwy:0, 2293-2295, 1pns:A, 137-139, 1pns:A, 309-311, 1pnx:A, 137-139, 1pnx:A, 309-311, 1pnx:A, 725-727, 1s1h:A, 310-312, 1s1h:A, 716-718, 1voq:A, 725-727, 1vos:A, 725-727, 1vov:A, 725-727, 1vox:A, 725-727, 1voz:A, 725-727, 1vs5:A, 310-312, 1vs6:B, 1609-1611, 1vs7:A, 310-312, 1vs8:B, 1609-1611, 1xmo:A, 132-134, 1xmo:A, 305-307, 1xmo:A, 711-713, 1xmq:A, 132-134, 1xmq:A, 305-307, 1xmq:A, 711-713, 1xnq:A, 132-134, 1xnq:A, 305-307, 1xnq:A, 711-713, 1xnr:A, 132-134, 1xnr:A, 305-307, 1xnr:A, 711-713, 1yl3:A, 963-965, 1yl4:A, 132-134, 1ysh:B, 81-83, 2avy:A, 310-312, 2aw4:B, 1609-1611, 2aw7:A, 310-312, 2awb:B, 1609-1611, 2b64:A, 132-134, 2b9m:A, 132-134, 2b9o:A, 132-134, 2e5l:A, 712-714, 2f4v:A, 132-134, 2f4v:A, 305-307, 2f4v:A, 711-713, 2gyb:A, 292-294, 2gyb:A, 560-562, 2hgi:A, 132-134, 2hgj:A, 148-150, 2hgp:A, 132-134, 2hgq:B, 67-69, 2hgr:A, 132-134, 2hhh:A, 711-713, 2i2p:A, 310-312, 2i2t:B, 1609-1611, 2i2u:A, 310-312, 2i2v:B, 1609-1611, 2j00:A, 132-134, 2j00:A, 711-713, 2j02:A, 132-134, 2j02:A, 711-713, 2j28:B, 1609-1611, 2jl5:A, 305-307, 2jl5:A, 711-713, 2jl7:A, 305-307, 2jl7:A, 711-713, 2ow8:y, 132-134, 2qal:A, 310-312, 2qam:B, 1609-1611, 2qan:A, 310-312, 2qao:B, 1609-1611, 2qb9:A, 310-312, 2qba:B, 1609-1611, 2qbb:A, 310-312, 2qbc:B, 1609-1611, 2qbd:A, 310-312, 2qbd:A, 494-496, 2qbe:B, 1609-1611, 2qbf:A, 310-312, 2qbf:A, 494-496, 2qbg:B, 1609-1611, 2qbh:A, 310-312, 2qbi:B, 1609-1611, 2qbj:A, 310-312, 2qbk:B, 1609-1611, 2qnh:y, 132-134, 2qou:A, 310-312, 2qou:A, 494-496, 2qov:B, 1609-1611, 2qow:A, 310-312, 2qox:B, 1609-1611, 2qoy:A, 310-312, 2qoz:B, 1609-1611, 2qp0:A, 310-312, 2qp1:B, 1609-1611, 2uu9:A, 132-134, 2uu9:A, 305-307, 2uu9:A, 711-713, 2uua:A, 132-134, 2uua:A, 305-307, 2uua:A, 711-713, 2uub:A, 132-134, 2uub:A, 305-307, 2uub:A, 711-713, 2uuc:A, 132-134, 2uuc:A, 305-307, 2uuc:A, 711-713, 2uxb:A, 132-134, 2uxb:A, 305-307, 2uxb:A, 711-713, 2uxc:A, 132-134, 2uxc:A, 305-307, 2uxc:A, 711-713, 2uxd:A, 128-130, 2uxd:A, 289-291, 2uxd:A, 689-691, 2v46:A, 132-134, 2v48:A, 132-134, 2vhm:B, 1609-1611, 2vhn:B, 1609-1611, 2vqe:A, 132-134, 2vqe:A, 305-307, 2vqe:A, 711-713, 2vqf:A, 132-134, 2vqf:A, 305-307, 2vqf:A, 711-713, 2z4k:A, 310-312, 2z4l:B, 1609-1611, 2z4m:A, 310-312, 2z4n:B, 1609-1611, 3bbn:A, 280-282, 3bbn:A, 675-677, 3bbo:A, 1583-1585, 3bbx:B, 1690-1692, 3d5a:A, 305-307, 3d5b:A, 388-390, 3d5c:A, 305-307, 3d5c:A, 711-713, 3d5d:A, 388-390, 3df1:A, 310-312, 3df2:B, 1609-1611, 3df3:A, 310-312, 3df4:B, 1609-1611
C
1voq:A, 740-742, 1vos:A, 740-742, 1vov:A, 740-742, 1vox:A, 740-742, 1voz:A, 740-742, 1z58:2, 2128-2130, 2gyc:0, 222-224, 2hgu:A, 2391-2393, 2jl6:A, 2358-2360, 2jl8:A, 2358-2360, 2nqp:F, 41-43, 2qus:A, 11-13, 2qus:B, 11-13
G
1c04:E, 5-7, 1c2w:B, 1055-1057, 1fjg:A, 565-567, 1fka:A, 557-559, 1hnw:A, 565-567, 1hnx:A, 565-567, 1hnz:A, 565-567, 1hr0:A, 1459-1461, 1hr0:A, 565-567, 1i94:A, 568-570, 1i95:A, 568-570, 1i96:A, 568-570, 1ibk:A, 565-567, 1ibl:A, 565-567, 1ibm:A, 565-567, 1j5a:A, 1583-1585, 1j5e:A, 565-567, 1jj2:0, 1128-1130, 1jzx:A, 1583-1585, 1jzy:A, 1583-1585, 1jzz:A, 1583-1585, 1k01:A, 1583-1585, 1k73:A, 1128-1130, 1k8a:A, 1128-1130, 1k9m:A, 1128-1130, 1kc8:A, 1128-1130, 1kd1:A, 1128-1130, 1kqs:0, 1128-1130, 1m1k:A, 1128-1130, 1m90:A, 1128-1130, 1mms:C, 5-7, 1mms:D, 5-7, 1n32:A, 565-567, 1n33:A, 565-567, 1n36:A, 565-567, 1n8r:A, 1128-1130, 1nji:A, 1128-1130, 1njm:0, 1575-1577, 1njm:0, 2766-2768, 1njn:0, 1575-1577, 1njn:0, 2766-2768, 1njo:0, 1575-1577, 1njo:0, 2766-2768, 1njp:0, 1575-1577, 1njp:0, 2766-2768, 1nkw:0, 1575-1577, 1nwx:0, 1575-1577, 1nwy:0, 1575-1577, 1oln:C, 5-7, 1ond:0, 1574-1576, 1p9x:0, 1551-1553, 1p9x:0, 977-979, 1pnu:0, 1591-1593, 1pnu:0, 2810-2812, 1pny:0, 1591-1593, 1pny:0, 2810-2812, 1q7y:A, 1128-1130, 1q81:A, 1128-1130, 1q82:A, 1128-1130, 1q86:A, 1128-1130, 1qa6:C, 5-7, 1qa6:D, 5-7, 1qvf:0, 1128-1130, 1qvg:0, 1128-1130, 1raw:A, 29-31, 1s1h:A, 570-572, 1s72:0, 1128-1130, 1sm1:0, 1575-1577, 1voq:A, 73-75, 1vos:A, 73-75, 1vov:A, 73-75, 1vox:A, 73-75, 1voz:A, 73-75, 1vq4:0, 1128-1130, 1vq5:0, 1128-1130, 1vq6:0, 1128-1130, 1vq7:0, 1128-1130, 1vq8:0, 1128-1130, 1vq9:0, 1128-1130, 1vqk:0, 1128-1130, 1vql:0, 1128-1130, 1vqm:0, 1128-1130, 1vqn:0, 1128-1130, 1vqo:0, 1128-1130, 1vqp:0, 1128-1130, 1vs5:A, 582-584, 1vs5:A, 728-730, 1vs7:A, 582-584, 1vs7:A, 728-730, 1vsa:w, 1649-1651, 1vsp:w, 1080-1082, 1vsp:w, 1649-1651, 1w2b:0, 1128-1130, 1xbp:0, 1575-1577, 1xmo:A, 565-567, 1xmq:A, 565-567, 1xnq:A, 565-567, 1xnr:A, 565-567, 1y69:0, 1575-1577, 1yhq:0, 1128-1130, 1yi2:0, 1128-1130, 1yij:0, 1128-1130, 1yit:0, 1128-1130, 1yj9:0, 1128-1130, 1yjn:0, 1128-1130, 1yjw:0, 1128-1130, 1yl4:A, 565-567, 2aar:0, 1575-1577, 2avy:A, 582-584, 2avy:A, 728-730, 2aw7:A, 582-584, 2aw7:A, 728-730, 2b9m:A, 565-567, 2d3o:0, 1000-1002, 2d3o:0, 1575-1577, 2e5l:A, 566-568, 2f4v:A, 565-567, 2gy9:A, 552-554, 2gy9:A, 698-700, 2gyb:A, 698-700, 2hgi:A, 565-567, 2hgi:A, 573-575, 2hgj:A, 1079-1081, 2hgp:A, 565-567, 2hgp:A, 573-575, 2hgr:A, 565-567, 2hgr:A, 573-575, 2i2p:A, 582-584, 2i2u:A, 582-584, 2j00:A, 565-567, 2j01:A, 1566-1568, 2j02:A, 565-567, 2j03:A, 1566-1568, 2jl5:A, 565-567, 2jl6:A, 1645-1647, 2jl7:A, 565-567, 2jl8:A, 1645-1647, 2o43:A, 1575-1577, 2o45:A, 1572-1574, 2o45:A, 997-999, 2ogm:0, 1575-1577, 2ogn:0, 1575-1577, 2ogo:0, 1574-1576, 2otj:0, 1128-1130, 2otl:0, 1128-1130, 2qal:A, 582-584, 2qal:A, 728-730, 2qan:A, 582-584, 2qan:A, 728-730, 2qb9:A, 582-584, 2qb9:A, 728-730, 2qbb:A, 582-584, 2qbb:A, 728-730, 2qbd:A, 582-584, 2qbd:A, 728-730, 2qbe:B, 1039-1041, 2qbf:A, 582-584, 2qbf:A, 728-730, 2qbh:A, 582-584, 2qbh:A, 728-730, 2qbi:B, 1039-1041, 2qbj:A, 582-584, 2qbj:A, 728-730, 2qou:A, 582-584, 2qou:A, 728-730, 2qov:B, 1039-1041, 2qow:A, 582-584, 2qow:A, 728-730, 2qox:B, 1039-1041, 2qoy:A, 582-584, 2qoy:A, 728-730, 2qp0:A, 582-584, 2qp0:A, 728-730, 2uu9:A, 565-567, 2uua:A, 565-567, 2uub:A, 565-567, 2uuc:A, 565-567, 2uxb:A, 565-567, 2uxc:A, 565-567, 2uxd:A, 543-545, 2vqe:A, 565-567, 2vqf:A, 565-567, 2z4k:A, 582-584, 2z4m:A, 582-584, 2zjp:X, 1553-1555, 2zjp:X, 978-980, 2zjq:X, 1553-1555, 2zjq:X, 978-980, 2zjr:X, 1550-1552, 2zjr:X, 975-977, 3bbn:A, 529-531, 3bbo:A, 1028-1030, 3bbo:A, 2519-2521, 3cc2:0, 1128-1130, 3cc4:0, 1128-1130, 3cc7:0, 1128-1130, 3cce:0, 1128-1130, 3ccl:0, 1128-1130, 3ccm:0, 1128-1130, 3ccq:0, 1128-1130, 3ccr:0, 1128-1130, 3ccs:0, 1128-1130, 3ccu:0, 1128-1130, 3ccv:0, 1128-1130, 3cd6:0, 1128-1130, 3cf5:X, 1553-1555, 3cf5:X, 978-980, 3cma:0, 1128-1130, 3cme:0, 1128-1130, 3cpw:0, 1128-1130, 3d5a:A, 565-567, 3d5b:A, 1644-1646, 3d5c:A, 565-567, 3d5d:A, 1644-1646, 3df1:A, 582-584, 3df1:A, 728-730, 3df3:A, 582-584, 3df3:A, 728-730, 3df4:B, 1039-1041, 3dll:X, 1553-1555, 3dll:X, 978-980
U
1c2w:B, 2085-2087, 1c2w:B, 2184-2186, 1j5a:A, 1400-1402, 1jzx:A, 1400-1402, 1jzy:A, 1400-1402, 1jzz:A, 1400-1402, 1k01:A, 1400-1402, 1njm:0, 1759-1761, 1njm:0, 2437-2439, 1njn:0, 1759-1761, 1njn:0, 2437-2439, 1njo:0, 1759-1761, 1njo:0, 2437-2439, 1njp:0, 1759-1761, 1njp:0, 2437-2439, 1nkw:0, 2437-2439, 1nwx:0, 2437-2439, 1nwy:0, 2437-2439, 1ond:0, 2436-2438, 1pnu:0, 1775-1777, 1pnu:0, 2481-2483, 1pny:0, 1775-1777, 1pny:0, 2481-2483, 1q81:A, 1860-1862, 1sm1:0, 1759-1761, 1sm1:0, 2437-2439, 1voq:A, 233-235, 1vor:B, 1775-1777, 1vor:B, 2481-2483, 1vos:A, 233-235, 1vou:B, 1775-1777, 1vou:B, 2481-2483, 1vov:A, 233-235, 1vow:B, 1775-1777, 1vow:B, 2481-2483, 1vox:A, 233-235, 1voy:B, 1775-1777, 1voy:B, 2481-2483, 1voz:A, 233-235, 1vp0:B, 2481-2483, 1vq5:0, 1860-1862, 1vq7:0, 1860-1862, 1vq8:0, 1860-1862, 1vq9:0, 1860-1862, 1vqk:0, 1860-1862, 1vql:0, 1860-1862, 1vqm:0, 1860-1862, 1vqn:0, 1860-1862, 1vqo:0, 1860-1862, 1vqp:0, 1860-1862, 1vs6:B, 2492-2494, 1vs8:B, 2492-2494, 1vsa:w, 1644-1646, 1vsa:w, 1842-1844, 1vsa:w, 2535-2537, 1vsp:w, 1644-1646, 1vsp:w, 1842-1844, 1vsp:w, 2535-2537, 1xbp:0, 1759-1761, 1y69:0, 1759-1761, 1y69:0, 2437-2439, 1yl3:A, 1842-1844, 1yl3:A, 2149-2151, 1yl3:A, 2521-2523, 2aar:0, 2437-2439, 2aw4:B, 2492-2494, 2awb:B, 2492-2494, 2b66:A, 1842-1844, 2b9n:A, 1842-1844, 2b9p:A, 1842-1844, 2d3o:0, 1759-1761, 2d3o:0, 2458-2460, 2hgj:A, 1842-1844, 2hgj:A, 2535-2537, 2hgq:A, 1842-1844, 2hgq:A, 2535-2537, 2hgu:A, 1842-1844, 2hgu:A, 2535-2537, 2i2t:B, 2492-2494, 2i2v:B, 2492-2494, 2j01:A, 1759-1761, 2j01:A, 2423-2425, 2j03:A, 1759-1761, 2j03:A, 2423-2425, 2j28:B, 2492-2494, 2jl6:A, 1838-1840, 2jl6:A, 2502-2504, 2jl8:A, 1838-1840, 2jl8:A, 2502-2504, 2o43:A, 1656-1658, 2o43:A, 2437-2439, 2o44:A, 1656-1658, 2o44:A, 948-950, 2o45:A, 1756-1758, 2o45:A, 2425-2427, 2ogm:0, 1656-1658, 2ogm:0, 1759-1761, 2ogm:0, 2437-2439, 2ogn:0, 1759-1761, 2ogn:0, 2437-2439, 2ogo:0, 1758-1760, 2ogo:0, 2436-2438, 2ow8:y, 1181-1183, 2ow8:y, 358-360, 2qam:B, 2492-2494, 2qao:B, 2492-2494, 2qba:B, 2492-2494, 2qbc:B, 2492-2494, 2qbe:B, 2492-2494, 2qbg:B, 2492-2494, 2qbi:B, 2492-2494, 2qbk:B, 2492-2494, 2qnh:y, 358-360, 2qov:B, 1604-1606, 2qov:B, 2492-2494, 2qox:B, 1604-1606, 2qox:B, 2492-2494, 2qoz:B, 1604-1606, 2qoz:B, 2492-2494, 2qp1:B, 1604-1606, 2qp1:B, 2492-2494, 2v47:A, 1759-1761, 2v47:A, 2418-2420, 2v49:A, 1759-1761, 2v49:A, 2418-2420, 2z4l:B, 2492-2494, 2z4n:B, 2492-2494, 2zjp:X, 1737-1739, 2zjp:X, 2348-2350, 2zjq:X, 1548-1550, 2zjq:X, 1737-1739, 2zjq:X, 2348-2350, 2zjr:X, 1734-1736, 2zjr:X, 2345-2347, 3bbn:A, 952-954, 3bbo:A, 1185-1187, 3bbx:B, 2775-2777, 3ccm:0, 1860-1862, 3cf5:X, 1737-1739, 3cf5:X, 2348-2350, 3cma:0, 1860-1862, 3cpw:0, 1860-1862, 3d5b:A, 1837-1839, 3d5b:A, 2530-2532, 3d5d:A, 1837-1839, 3d5d:A, 2530-2532, 3df2:B, 2492-2494, 3df4:B, 2492-2494, 3dll:X, 1737-1739, 3dll:X, 2348-2350