Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(001)-Segment cluster 16 (cutoff=0.5 Å with sequence identity)
Cluster size 473 structure(s)
Representative structure 1c0a:B (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence U
Cluster members
U
1c0a:B, 65-67, 1c2w:B, 2138-2140, 1c2w:B, 396-398, 1efw:C, 65-67, 1efw:D, 65-67, 1ffk:0, 839-841, 1fjg:A, 191-193, 1fka:A, 1177-1179, 1fka:A, 1474-1476, 1fka:A, 191-193, 1fka:A, 639-641, 1foq:A, 11-13, 1foq:A, 19-21, 1foq:B, 11-13, 1foq:B, 19-21, 1foq:C, 11-13, 1foq:C, 19-21, 1foq:D, 11-13, 1foq:D, 19-21, 1foq:E, 11-13, 1foq:E, 19-21, 1gid:A, 32-34, 1gid:B, 32-34, 1grz:B, 39-41, 1grz:B, 48-50, 1hnw:A, 191-193, 1hnx:A, 191-193, 1hnz:A, 191-193, 1hr0:A, 191-193, 1hr2:A, 32-34, 1hr2:B, 33-35, 1i94:A, 194-196, 1i94:A, 814-816, 1i94:A, 825-827, 1i95:A, 1102-1104, 1i95:A, 194-196, 1i96:A, 996-998, 1i97:A, 1407-1409, 1i97:A, 607-609, 1i97:A, 825-827, 1ibk:A, 191-193, 1ibl:A, 191-193, 1ibm:A, 1402-1404, 1ibm:A, 191-193, 1j5a:A, 1123-1125, 1j5a:A, 2238-2240, 1j5e:A, 191-193, 1jj2:0, 843-845, 1jo7:A, 2-4, 1jzx:A, 1123-1125, 1jzx:A, 2238-2240, 1jzy:A, 1123-1125, 1jzy:A, 2238-2240, 1jzz:A, 1123-1125, 1jzz:A, 2238-2240, 1k01:A, 1123-1125, 1k01:A, 2238-2240, 1k73:A, 843-845, 1k8a:A, 843-845, 1k9m:A, 843-845, 1kc8:A, 843-845, 1kd1:A, 843-845, 1kqs:0, 843-845, 1l8v:A, 32-34, 1l8v:B, 32-34, 1m1k:A, 843-845, 1m90:A, 843-845, 1n32:A, 191-193, 1n33:A, 1444-1446, 1n33:A, 191-193, 1n34:A, 1050-1052, 1n34:A, 750-752, 1n34:A, 922-924, 1n36:A, 1494-1496, 1n36:A, 191-193, 1n36:A, 213-215, 1n36:A, 569-571, 1n36:A, 922-924, 1n8r:A, 843-845, 1nji:A, 843-845, 1njm:0, 1433-1435, 1njm:0, 512-514, 1njn:0, 1433-1435, 1njn:0, 512-514, 1njo:0, 1433-1435, 1njp:0, 1433-1435, 1njp:0, 512-514, 1nkw:0, 1433-1435, 1nkw:0, 1720-1722, 1nkw:0, 2059-2061, 1nkw:0, 2428-2430, 1nwx:0, 1433-1435, 1nwx:0, 1720-1722, 1nwx:0, 2059-2061, 1nwx:0, 2428-2430, 1nwy:0, 1433-1435, 1nwy:0, 1720-1722, 1nwy:0, 2059-2061, 1nwy:0, 2428-2430, 1ond:0, 1433-1435, 1ond:0, 1719-1721, 1ond:0, 2058-2060, 1ond:0, 2427-2429, 1p9x:0, 1977-1979, 1p9x:0, 2099-2101, 1p9x:0, 2516-2518, 1p9x:0, 2559-2561, 1pnu:0, 1449-1451, 1pnu:0, 512-514, 1pny:0, 1449-1451, 1pny:0, 512-514, 1q7y:A, 843-845, 1q81:A, 843-845, 1q82:A, 843-845, 1q86:A, 843-845, 1qvf:0, 843-845, 1qvg:0, 843-845, 1r2p:A, 8-10, 1s1h:A, 193-195, 1s1i:3, 842-844, 1s72:0, 843-845, 1sm1:0, 1433-1435, 1sm1:0, 2059-2061, 1un6:F, 32-34, 1un6:F, 41-43, 1vor:A, 91-93, 1vor:B, 1527-1529, 1vor:B, 1766-1768, 1vor:B, 2027-2029, 1vor:B, 2168-2170, 1vor:B, 2722-2724, 1vou:A, 91-93, 1vou:B, 1527-1529, 1vou:B, 1766-1768, 1vou:B, 2027-2029, 1vou:B, 2168-2170, 1vow:A, 91-93, 1vow:B, 1527-1529, 1vow:B, 1766-1768, 1vow:B, 2027-2029, 1vow:B, 2168-2170, 1vow:B, 2722-2724, 1voy:A, 91-93, 1voy:B, 1527-1529, 1voy:B, 1766-1768, 1voy:B, 2027-2029, 1voy:B, 2168-2170, 1voy:B, 2722-2724, 1vp0:A, 91-93, 1vp0:B, 1527-1529, 1vp0:B, 1766-1768, 1vp0:B, 2027-2029, 1vp0:B, 2168-2170, 1vp0:B, 2722-2724, 1vq4:0, 843-845, 1vq5:0, 843-845, 1vq6:0, 843-845, 1vq7:0, 843-845, 1vq8:0, 843-845, 1vq9:0, 843-845, 1vqk:0, 843-845, 1vql:0, 843-845, 1vqm:0, 843-845, 1vqn:0, 843-845, 1vqo:0, 843-845, 1vqp:0, 843-845, 1vs5:A, 468-470, 1vs6:B, 2131-2133, 1vs6:B, 2179-2181, 1vs7:A, 468-470, 1vs8:B, 2069-2071, 1vs8:B, 2131-2133, 1vs8:B, 2179-2181, 1w2b:0, 843-845, 1wsu:E, 4-6, 1wsu:F, 4-6, 1wsu:G, 4-6, 1xbp:0, 1720-1722, 1xbp:0, 2002-2004, 1xbp:0, 2059-2061, 1xbp:0, 2124-2126, 1xbp:0, 553-555, 1xmo:A, 191-193, 1xmq:A, 191-193, 1xnq:A, 1176-1178, 1xnq:A, 1396-1398, 1xnr:A, 1176-1178, 1xnr:A, 191-193, 1y69:0, 1190-1192, 1y69:0, 2002-2004, 1y69:0, 2020-2022, 1y69:0, 2124-2126, 1y69:0, 553-555, 1y69:0, 817-819, 1yhq:0, 550-552, 1yhq:0, 843-845, 1yi2:0, 550-552, 1yi2:0, 843-845, 1yij:0, 550-552, 1yij:0, 843-845, 1yit:0, 550-552, 1yit:0, 843-845, 1yj9:0, 550-552, 1yj9:0, 843-845, 1yjn:0, 843-845, 1yjw:0, 550-552, 1yjw:0, 843-845, 1yl3:A, 2208-2210, 1yl3:A, 2624-2626, 1yl4:A, 1050-1052, 1yl4:A, 113-115, 1yl4:A, 1368-1370, 1yl4:A, 581-583, 1yl4:A, 809-811, 1yl4:A, 822-824, 1z43:A, 97-99, 1z58:2, 1181-1183, 1z58:2, 1253-1255, 1z58:2, 1662-1664, 1z58:2, 1993-1995, 1z58:2, 2-4, 1z58:2, 2103-2105, 1z58:2, 2289-2291, 1z58:2, 281-283, 1z58:2, 884-886, 2aar:0, 2059-2061, 2avy:A, 468-470, 2aw4:B, 2131-2133, 2aw4:B, 2179-2181, 2aw7:A, 468-470, 2awb:B, 2069-2071, 2awb:B, 2131-2133, 2awb:B, 2179-2181, 2b64:A, 191-193, 2b66:A, 2566-2568, 2b9m:A, 191-193, 2b9n:A, 2566-2568, 2b9o:A, 191-193, 2b9p:A, 2566-2568, 2d3o:0, 1190-1192, 2d3o:0, 1433-1435, 2d3o:0, 1511-1513, 2d3o:0, 2002-2004, 2d3o:0, 2067-2069, 2d3o:0, 2145-2147, 2d3o:0, 553-555, 2e5l:A, 192-194, 2f4v:A, 191-193, 2f4v:A, 822-824, 2f4v:A, 922-924, 2gv4:A, 5-7, 2gy9:A, 113-115, 2gy9:A, 568-570, 2gya:0, 1324-1326, 2gya:0, 1968-1970, 2gya:0, 2067-2069, 2gya:0, 2103-2105, 2gya:0, 2132-2134, 2gya:0, 2554-2556, 2gyb:A, 1032-1034, 2gyb:A, 113-115, 2gyc:0, 1324-1326, 2gyc:0, 1406-1408, 2gyc:0, 2070-2072, 2gyc:0, 2554-2556, 2hgi:A, 191-193, 2hgj:A, 2222-2224, 2hgj:A, 781-783, 2hgp:A, 191-193, 2hgq:A, 2222-2224, 2hgq:A, 781-783, 2hgr:A, 113-115, 2hgr:A, 191-193, 2hgu:A, 2222-2224, 2hgu:A, 781-783, 2hhh:A, 191-193, 2i2p:A, 468-470, 2i2t:B, 2131-2133, 2i2t:B, 2179-2181, 2i2u:A, 468-470, 2i2v:B, 2069-2071, 2i2v:B, 2179-2181, 2j00:A, 191-193, 2j01:A, 2002-2004, 2j01:A, 2110-2112, 2j02:A, 191-193, 2j03:A, 2002-2004, 2j03:A, 2110-2112, 2j28:B, 2069-2071, 2j28:B, 2131-2133, 2j28:B, 2179-2181, 2jl6:A, 2081-2083, 2jl6:A, 2189-2191, 2jl6:A, 792-794, 2jl8:A, 2081-2083, 2jl8:A, 2189-2191, 2jl8:A, 792-794, 2nz4:S, 18-20, 2o43:A, 2002-2004, 2o43:A, 284-286, 2o44:A, 1433-1435, 2o44:A, 1541-1543, 2o44:A, 2002-2004, 2o44:A, 786-788, 2o45:A, 1747-1749, 2o45:A, 1999-2001, 2o45:A, 2112-2114, 2ogm:0, 2059-2061, 2ogm:0, 733-735, 2ogm:0, 911-913, 2ogn:0, 1720-1722, 2ogo:0, 2001-2003, 2ogo:0, 283-285, 2otj:0, 843-845, 2otl:0, 843-845, 2qa4:0, 1521-1523, 2qa4:0, 723-725, 2qa4:0, 842-844, 2qal:A, 468-470, 2qam:B, 2069-2071, 2qam:B, 2179-2181, 2qan:A, 468-470, 2qao:B, 2069-2071, 2qao:B, 2131-2133, 2qao:B, 2179-2181, 2qb9:A, 468-470, 2qba:B, 2069-2071, 2qba:B, 2179-2181, 2qbb:A, 468-470, 2qbc:B, 2069-2071, 2qbc:B, 2131-2133, 2qbc:B, 2179-2181, 2qbd:A, 468-470, 2qbe:B, 2069-2071, 2qbe:B, 2131-2133, 2qbe:B, 2179-2181, 2qbf:A, 468-470, 2qbg:B, 2069-2071, 2qbg:B, 2131-2133, 2qbg:B, 2179-2181, 2qbh:A, 468-470, 2qbi:B, 2069-2071, 2qbi:B, 2179-2181, 2qbj:A, 468-470, 2qbk:B, 2069-2071, 2qbk:B, 2131-2133, 2qbk:B, 2179-2181, 2qex:0, 843-845, 2qou:A, 468-470, 2qov:B, 2069-2071, 2qov:B, 2179-2181, 2qow:A, 468-470, 2qox:B, 2069-2071, 2qox:B, 2131-2133, 2qox:B, 2179-2181, 2qoy:A, 468-470, 2qoz:B, 2069-2071, 2qoz:B, 2179-2181, 2qp0:A, 468-470, 2qp1:B, 2069-2071, 2qp1:B, 2131-2133, 2qp1:B, 2179-2181, 2r8s:R, 33-35, 2uu9:A, 191-193, 2uua:A, 191-193, 2uub:A, 191-193, 2uuc:A, 191-193, 2uwm:C, 4-6, 2uxb:A, 191-193, 2uxc:A, 191-193, 2uxd:A, 1246-1248, 2uxd:A, 996-998, 2v3c:M, 15-17, 2v46:A, 1181-1183, 2v47:A, 1650-1652, 2v47:A, 2002-2004, 2v47:A, 2105-2107, 2v47:A, 2134-2136, 2v47:A, 765-767, 2v48:A, 1181-1183, 2v48:A, 1484-1486, 2v49:A, 1650-1652, 2v49:A, 2002-2004, 2v49:A, 2105-2107, 2v49:A, 2134-2136, 2v49:A, 765-767, 2vhm:B, 2069-2071, 2vhm:B, 597-599, 2vhm:B, 708-710, 2vhm:B, 950-952, 2vhn:B, 2069-2071, 2vhn:B, 3-5, 2vhn:B, 597-599, 2vhn:B, 708-710, 2vhn:B, 950-952, 2vho:A, 654-656, 2vhp:A, 1517-1519, 2vqe:A, 191-193, 2vqf:A, 191-193, 2z4k:A, 468-470, 2z4l:B, 2069-2071, 2z4l:B, 2179-2181, 2z4m:A, 468-470, 2z4n:B, 2069-2071, 2z4n:B, 2131-2133, 2z4n:B, 2179-2181, 2zjp:X, 1963-1965, 2zjp:X, 2035-2037, 2zjq:X, 1411-1413, 2zjq:X, 1963-1965, 2zjr:X, 1960-1962, 2zjr:X, 2032-2034, 3bbn:A, 1236-1238, 3bbo:A, 2200-2202, 3bbo:A, 2655-2657, 3bbx:B, 2405-2407, 3bbx:B, 2453-2455, 3cc2:0, 550-552, 3cc2:0, 843-845, 3cc4:0, 550-552, 3cc4:0, 843-845, 3cc7:0, 550-552, 3cc7:0, 843-845, 3cce:0, 550-552, 3cce:0, 843-845, 3ccj:0, 843-845, 3ccl:0, 550-552, 3ccl:0, 843-845, 3ccm:0, 550-552, 3ccm:0, 843-845, 3ccq:0, 550-552, 3ccq:0, 843-845, 3ccr:0, 550-552, 3ccr:0, 843-845, 3ccs:0, 550-552, 3ccs:0, 843-845, 3ccu:0, 550-552, 3ccu:0, 843-845, 3ccv:0, 550-552, 3ccv:0, 843-845, 3cd6:0, 550-552, 3cd6:0, 843-845, 3cma:0, 550-552, 3cma:0, 843-845, 3cme:0, 550-552, 3cme:0, 843-845, 3cpw:0, 843-845, 3d5a:A, 1195-1197, 3d5a:A, 191-193, 3d5a:A, 972-974, 3d5b:A, 1178-1180, 3d5b:A, 2080-2082, 3d5b:A, 2096-2098, 3d5b:A, 2217-2219, 3d5b:A, 777-779, 3d5b:B, 95-97, 3d5c:A, 1195-1197, 3d5c:A, 191-193, 3d5c:A, 972-974, 3d5d:A, 1178-1180, 3d5d:A, 2080-2082, 3d5d:A, 2096-2098, 3d5d:A, 2217-2219, 3d5d:A, 777-779, 3d5d:B, 95-97, 3df1:A, 468-470, 3df2:B, 2069-2071, 3df2:B, 2179-2181, 3df3:A, 468-470, 3df4:B, 2069-2071, 3df4:B, 2179-2181, 3dll:X, 1411-1413, 3dll:X, 707-709