1ffk:0, 1621-1624
1ffk:0, 1860-1863
1fjg:A, 59-62
1fjg:A, 1030-1033
1hnw:A, 59-62
1hnw:A, 1030-1033
1hnx:A, 59-62
1hnx:A, 1030-1033
1hnz:A, 59-62
1hnz:A, 1030-1033
1hr0:A, 59-62
1hr0:A, 1030-1033
1i94:A, 62-65
1i95:A, 62-65
1i95:A, 1033-1036
1i96:A, 62-65
1i96:A, 1033-1036
1ibk:A, 59-62
1ibk:A, 1030-1033
1ibl:A, 59-62
1ibm:A, 59-62
1ibm:A, 1030-1033
1j5e:A, 59-62
1j5e:A, 1030-1033
1jj2:0, 1671-1674
1jj2:0, 1910-1913
1k73:A, 1671-1674
1k73:A, 1910-1913
1k8a:A, 1671-1674
1k8a:A, 1910-1913
1k9m:A, 1671-1674
1k9m:A, 1910-1913
1kc8:A, 1671-1674
1kc8:A, 1910-1913
1kd1:A, 1671-1674
1kd1:A, 1910-1913
1kqs:0, 1671-1674
1kqs:0, 1910-1913
1m1k:A, 1671-1674
1m1k:A, 1910-1913
1m90:A, 1671-1674
1m90:A, 1910-1913
1n32:A, 59-62
1n32:A, 1030-1033
1n33:A, 59-62
1n34:A, 59-62
1n8r:A, 1671-1674
1n8r:A, 1910-1913
1nbk:A, 6-9
1nbk:A, 22-25
1nbs:B, 142-145
1nji:A, 1671-1674
1nji:A, 1910-1913
1pns:A, 59-62
1pns:A, 1046-1049
1pnx:A, 59-62
1pnx:A, 1046-1049
1q7y:A, 1671-1674
1q7y:A, 1910-1913
1q81:A, 1671-1674
1q81:A, 1910-1913
1q82:A, 1671-1674
1q82:A, 1910-1913
1q86:A, 1671-1674
1q86:A, 1910-1913
1qvf:0, 1671-1674
1qvf:0, 1910-1913
1qvg:0, 1671-1674
1qvg:0, 1910-1913
1s1h:A, 59-62
1s1h:A, 1031-1034
1s1i:3, 1779-1782
1s1i:3, 2018-2021
1s72:0, 1671-1674
1s72:0, 1910-1913
1sm1:0, 1815-1818
1voq:A, 59-62
1vos:A, 59-62
1vov:A, 59-62
1vox:A, 59-62
1voz:A, 59-62
1vq4:0, 1671-1674
1vq4:0, 1910-1913
1vq5:0, 1671-1674
1vq5:0, 1910-1913
1vq6:0, 1671-1674
1vq6:0, 1910-1913
1vq7:0, 1671-1674
1vq7:0, 1910-1913
1vq8:0, 1910-1913
1vq9:0, 1910-1913
1vqk:0, 1910-1913
1vql:0, 1910-1913
1vqm:0, 1910-1913
1vqn:0, 1910-1913
1vqo:0, 1910-1913
1vqp:0, 1910-1913
1vs5:A, 59-62
1vs5:A, 1048-1051
1vs6:B, 1882-1885
1vs7:A, 59-62
1vs7:A, 1048-1051
1vs8:B, 1882-1885
1vsp:w, 967-970
1vsp:w, 1898-1901
1w2b:0, 1910-1913
1xbp:0, 1815-1818
1xmo:A, 59-62
1xmo:A, 1025-1028
1xmq:A, 59-62
1xmq:A, 1025-1028
1xnq:A, 59-62
1xnr:A, 59-62
1y69:0, 1815-1818
1yhq:0, 1910-1913
1yi2:0, 1671-1674
1yi2:0, 1910-1913
1yij:0, 1671-1674
1yij:0, 1910-1913
1yit:0, 1671-1674
1yit:0, 1910-1913
1yj9:0, 1910-1913
1yjn:0, 1671-1674
1yjn:0, 1910-1913
1yjw:0, 1671-1674
1yjw:0, 1910-1913
1yl3:A, 1898-1901
1yl4:A, 59-62
2aar:0, 1815-1818
2avy:A, 59-62
2avy:A, 1048-1051
2aw4:B, 1882-1885
2aw7:A, 59-62
2aw7:A, 1048-1051
2awb:B, 1882-1885
2b64:A, 59-62
2b9m:A, 59-62
2b9o:A, 59-62
2e5l:A, 60-63
2e5l:A, 1031-1034
2f4v:A, 59-62
2f4v:A, 1030-1033
2gy9:A, 59-62
2gy9:A, 1012-1015
2gyb:A, 59-62
2gyb:A, 1012-1015
2gyc:0, 1546-1549
2hgi:A, 59-62
2hgj:A, 1898-1901
2hgp:A, 59-62
2hgq:A, 1898-1901
2hgr:A, 59-62
2hgu:A, 1898-1901
2hhh:A, 59-62
2hhh:A, 1030-1033
2i2p:A, 59-62
2i2p:A, 1048-1051
2i2t:B, 1882-1885
2i2u:A, 59-62
2i2u:A, 1048-1051
2i2v:B, 1882-1885
2j00:A, 59-62
2j00:A, 1030-1033
2j01:A, 1815-1818
2j02:A, 59-62
2j02:A, 1030-1033
2j03:A, 1815-1818
2j28:B, 1882-1885
2jl5:A, 59-62
2jl5:A, 1030-1033
2jl6:A, 1894-1897
** 2jl7:A, 59-62
2jl7:A, 1030-1033
2jl8:A, 1894-1897
2ogo:0, 1814-1817
2om7:G, 50-53
2otj:0, 1910-1913
2otl:0, 1671-1674
2otl:0, 1910-1913
2ow8:y, 59-62
2qa4:0, 1676-1679
2qa4:0, 1915-1918
2qal:A, 59-62
2qal:A, 1048-1051
2qam:B, 1882-1885
2qan:A, 59-62
2qan:A, 1048-1051
2qao:B, 1882-1885
2qb9:A, 59-62
2qb9:A, 1048-1051
2qba:B, 1882-1885
2qbb:A, 59-62
2qbb:A, 1048-1051
2qbc:B, 1882-1885
2qbd:A, 59-62
2qbd:A, 1048-1051
2qbe:B, 1882-1885
2qbf:A, 59-62
2qbf:A, 1048-1051
2qbg:B, 1882-1885
2qbh:A, 59-62
2qbh:A, 1048-1051
2qbi:B, 1882-1885
2qbj:A, 59-62
2qbj:A, 1048-1051
2qbk:B, 1882-1885
2qex:0, 1910-1913
2qnh:y, 59-62
2qou:A, 59-62
2qou:A, 1048-1051
2qov:B, 1882-1885
2qow:A, 59-62
2qow:A, 1048-1051
2qox:B, 1882-1885
2qoy:A, 59-62
2qoy:A, 1048-1051
2qoz:B, 1882-1885
2qp0:A, 59-62
2qp0:A, 1048-1051
2qp1:B, 1882-1885
2uu9:A, 59-62
2uu9:A, 1030-1033
2uua:A, 59-62
2uua:A, 1030-1033
2uub:A, 59-62
2uub:A, 1030-1033
2uuc:A, 59-62
2uuc:A, 1030-1033
2uxb:A, 59-62
2uxc:A, 59-62
2uxc:A, 1030-1033
2uxd:A, 59-62
2v46:A, 59-62
2v47:A, 1815-1818
2v48:A, 59-62
2v49:A, 1815-1818
2vqe:A, 59-62
2vqe:A, 1030-1033
2vqf:A, 59-62
2vqf:A, 1030-1033
2z4k:A, 59-62
2z4k:A, 1048-1051
2z4l:B, 1882-1885
2z4m:A, 59-62
2z4m:A, 1048-1051
2z4n:B, 1882-1885
2zjp:X, 1793-1796
2zjq:X, 1793-1796
2zjr:X, 1790-1793
3bbn:A, 59-62
3bbn:A, 996-999
3bbx:B, 1975-1978
3cc2:0, 1910-1913
3cc4:0, 1910-1913
3cc7:0, 1910-1913
3cce:0, 1910-1913
3ccj:0, 1671-1674
3ccj:0, 1910-1913
3ccl:0, 1910-1913
3ccm:0, 1910-1913
3ccq:0, 1910-1913
3ccr:0, 1671-1674
3ccr:0, 1910-1913
3ccs:0, 1671-1674
3ccs:0, 1910-1913
3ccu:0, 1910-1913
3ccv:0, 1910-1913
3cd6:0, 1910-1913
3cf5:X, 1793-1796
3cma:0, 1910-1913
3cme:0, 1910-1913
3cpw:0, 1910-1913
3d5a:A, 59-62
3d5b:A, 1893-1896
3d5c:A, 59-62
3d5d:A, 1893-1896
3df1:A, 59-62
3df1:A, 1048-1051
3df2:B, 1882-1885
3df3:A, 59-62
3df3:A, 1048-1051
3df4:B, 1882-1885
Content-type: text/html

<html>

<!DOCTYPE HTML PUBLIC 
"-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN"
"http://www.w3.org/TR/html401/loose.dtd">

<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<meta http-equiv="Content-Script-Type" content="text/javascript">
<meta http-equiv="Content-Style-Type" content="text/css">


<title>RNA Loop Modeling</title>


<link href=/rloom.css rel=stylesheet type=text/css>

<script src="../jmol/Jmol.js" type="text/javascript"></script>

<!-- Piwik -->
<script type="text/javascript">
  var _paq = _paq || [];
  // tracker methods like "setCustomDimension" should be called before "trackPageView"
  _paq.push(['trackPageView']);
  _paq.push(['enableLinkTracking']);
  (function() {
    var u="//piwik.mpg.de/piwik/";
    _paq.push(['setTrackerUrl', u+'piwik.php']);
    _paq.push(['setSiteId', '239']);
    var d=document, g=d.createElement('script'),
s=d.getElementsByTagName('script')[0];
    g.type='text/javascript'; g.async=true; g.defer=true;
g.src=u+'piwik.js'; s.parentNode.insertBefore(g,s);
  })();
</script>
<noscript><p><img src="//piwik.mpg.de/piwik/piwik.php?idsite=239&rec=1"
style="border:0;" alt="" /></p></noscript>
<!-- End Piwik Code -->

</head>


<body >

<div
 id="maincontainer"
 style="height:1300px;">

  <div
   style="position:absolute;
   top:10px;
   height:185px;
   right:10px;
   background-color:#ffffff;
   width:1000px;
   border-width: 2px;
   border-style: solid;
   border-color:#003333; ">

    <div
     style="position:absolute;
     left:10px;" >
     <img src="/img/rloom_logo2.jpg">
    </div>

    <div
     style="position:absolute;
     top:10px;
     right:10px;">
     <a href="http://www.mpimp-golm.mpg.de" target="_blank">
     <!-- <img
       src="http://www.mpimp-golm.mpg.de/portal_img/mpimp_logo_150x69.png"
       border="0"> -->
     <img                                                               
       src="/img/logo_mpimp.jpg"
       height=69 border="0"> 
     </a>
    </div>

    <div
     style="position:absolute;
     top:100px;
     right:15px;">
     <a href="http://www.mpg.de" target="_blank">	
     <img src="/img/logo_mps.png" height=69>
     <!-- <img src="http://www.mpimp-golm.mpg.de/portal_img/minerva_logo.gif"> -->
     </a>
    </div>

  </div>

  <div id="menucontainer">

    <div class="menuitem" id="menuitem0">
    <a class="menu" href="/cgi-bin/index.py">Home</a>
    </div>

    <div class="menuitem" id="menuitem1">
    <a class="menu" href="/cgi-bin/index.py?show=help">Help</a>
    </div>

    <div class="menuitem" id="menuitem2">
    <a class="menu" href="/cgi-bin/index.py?show=supplement">
    Supplementary Data</a>
    </div>
    
    <div class="menuitem" id="menuitem3">
    <a class="menu" href="/cgi-bin/index.py?show=contact">Contact</a>
    </div>

    <div class="menuitem" id="menuitem4">
    <a class="menu" href="http://www.mpimp-golm.mpg.de/2278/impress" target="_blank">Imprint</a> /  
    <a class="menu" href="http://www.mpimp-golm.mpg.de/2042773/Privacy-Policy" target="_blank">Privacy policy</a>
    </div>

    <!--<div class=menuitem id=menuitem1>
    <a class=menu href=/cgi-bin/rloom.py>Loop Modeling</a>
    </div>-->
    
  </div>

  <div id=modelcontainer>
  <div class=menuitem id=modelitem0>
  <a class=menu href=/cgi-bin/rloom.py>Model new loop</a>
  </div>

  <div class=menuitem id=modelitem1>
  
  <label for=session>
  <a class=menu>Fetch session</a>
  </label><br>

  <form
  action=/cgi-bin/rloom.py
  method=post
  enctype=multipart/form-data>
 
 <input type=hidden name=fid value=modeling> 

 <input type=text style="margin-left:1em; margin-top:1em;height:15pt; font-size:8pt;"
  name=session id=session><br>


 <input
  style="margin-left:1em; height:15pt; font-size:8pt;"
  type=submit
  value=Fetch
  id=submit />
  </form>
  
  </div>
  
  </div>

  <div id=citecontainer>
  <div class=citeitem id=citeitem0>
  <b>Please cite:</b><br>
  Schudoma et al.,<br>
  Nucl. Acids Res. 38: 970-980.<br>
  DOI 10.1093/nar/gkp1010.<br>
  </div>
  </div>
  

  <div id="contentcontainer">
   <div
    style="position:absolute; top:25px; left:10px; right:10px;">  
   
  </div>

 </div>

</div>

</body>

</html>