Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(006)-Hairpin cluster 1416 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 123 structure(s)
Representative structure 3cpw:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GCAADR
Cluster members
GCAAAG
1j5a:A, 2224-2231, 1jzx:A, 2224-2231, 1jzy:A, 2224-2231, 1jzz:A, 2224-2231, 1k01:A, 2224-2231, 1vor:B, 2260-2267, 1vou:B, 2260-2267, 1vow:B, 2260-2267, 1voy:B, 2260-2267, 1vp0:B, 2260-2267, 2aar:0, 2216-2223, 2o43:A, 2216-2223, 2o44:A, 2216-2223, 2o45:A, 2204-2211, 2ogo:0, 2215-2222, 2zjr:X, 2124-2131
GCAAGA
1ffk:0, 2171-2178, 1ffz:A, 197-204, 1fg0:A, 197-204, 1jj2:0, 2221-2228, 1k73:A, 2221-2228, 1k8a:A, 2221-2228, 1k9m:A, 2221-2228, 1kc8:A, 2221-2228, 1kd1:A, 2221-2228, 1kqs:0, 2221-2228, 1m1k:A, 2221-2228, 1m90:A, 2221-2228, 1n8r:A, 2221-2228, 1nji:A, 2221-2228, 1q7y:A, 2221-2228, 1q81:A, 2221-2228, 1q82:A, 2221-2228, 1q86:A, 2221-2228, 1qvf:0, 2221-2228, 1qvg:0, 2221-2228, 1s1i:3, 2538-2545, 1s72:0, 2221-2228, 1vq4:0, 2221-2228, 1vq5:0, 2221-2228, 1vq6:0, 2221-2228, 1vq7:0, 2221-2228, 1vq8:0, 2221-2228, 1vq9:0, 2221-2228, 1vqk:0, 2221-2228, 1vql:0, 2221-2228, 1vqm:0, 2221-2228, 1vqn:0, 2221-2228, 1vqo:0, 2221-2228, 1vqp:0, 2221-2228, 1w2b:0, 2221-2228, 1yhq:0, 2221-2228, 1yi2:0, 2221-2228, 1yij:0, 2221-2228, 1yit:0, 2221-2228, 1yj9:0, 2221-2228, 1yjn:0, 2221-2228, 1yjw:0, 2221-2228, 2otj:0, 2221-2228, 2otl:0, 2221-2228, 2qa4:0, 2226-2233, 2qex:0, 2221-2228, 3cc2:0, 2221-2228, 3cc4:0, 2221-2228, 3cc7:0, 2221-2228, 3cce:0, 2221-2228, 3ccj:0, 2221-2228, 3ccl:0, 2221-2228, 3ccm:0, 2221-2228, 3ccq:0, 2221-2228, 3ccr:0, 2221-2228, 3ccs:0, 2221-2228, 3ccu:0, 2221-2228, 3ccv:0, 2221-2228, 3cd6:0, 2221-2228, 3cma:0, 2221-2228, 3cme:0, 2221-2228, 3cpw:0, 2221-2228
GCAAGG
1vsa:w, 2314-2321, 1vsp:w, 2314-2321, 1yl3:A, 2300-2307, 2b66:A, 2242-2249, 2b9n:A, 2242-2249, 2b9p:A, 2242-2249, 2hgj:A, 2314-2321, 2hgq:A, 2314-2321, 2hgu:A, 2314-2321, 2j01:A, 2202-2209, 2j03:A, 2202-2209, 2jl6:A, 2281-2288, 2jl8:A, 2281-2288, 2v47:A, 2197-2204, 2v49:A, 2197-2204, 3d5b:A, 2309-2316, 3d5d:A, 2309-2316
GCAAUG
1vs6:B, 2271-2278, 1vs8:B, 2271-2278, 2aw4:B, 2271-2278, 2awb:B, 2271-2278, 2gya:0, 2190-2197, 2gyc:0, 2190-2197, 2i2t:B, 2271-2278, 2i2v:B, 2271-2278, 2j28:B, 2271-2278, 2qam:B, 2271-2278, 2qao:B, 2271-2278, 2qba:B, 2271-2278, 2qbc:B, 2271-2278, 2qbe:B, 2271-2278, 2qbg:B, 2271-2278, 2qbi:B, 2271-2278, 2qbk:B, 2271-2278, 2qov:B, 2271-2278, 2qox:B, 2271-2278, 2qoz:B, 2271-2278, 2qp1:B, 2271-2278, 2vhm:B, 2271-2278, 2vhn:B, 2271-2278, 2z4l:B, 2271-2278, 2z4n:B, 2271-2278, 3bbx:B, 2548-2555, 3df2:B, 2271-2278, 3df4:B, 2271-2278