Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(004)-Segment cluster 3695 (cutoff=2.0 Å)
Cluster size 136 structure(s)
Representative structure 2qa4:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NDNN
Cluster members
AAGC
2vhp:A, 932-937
CAAU
2ow8:y, 362-367
CGGU
1ffk:0, 1372-1377, 1jj2:0, 1419-1424, 1k73:A, 1419-1424, 1k8a:A, 1419-1424, 1k9m:A, 1419-1424, 1kc8:A, 1419-1424, 1kd1:A, 1419-1424, 1kqs:0, 1419-1424, 1m1k:A, 1419-1424, 1m90:A, 1419-1424, 1n8r:A, 1419-1424, 1nji:A, 1419-1424, 1q7y:A, 1419-1424, 1q81:A, 1419-1424, 1q82:A, 1419-1424, 1q86:A, 1419-1424, 1qvf:0, 1419-1424, 1qvg:0, 1419-1424, 1s1i:3, 1530-1535, 1s72:0, 1419-1424, 1vq4:0, 1419-1424, 1vq5:0, 1419-1424, 1vq6:0, 1419-1424, 1vq7:0, 1419-1424, 1vq8:0, 1419-1424, 1vq9:0, 1419-1424, 1vqk:0, 1419-1424, 1vql:0, 1419-1424, 1vqm:0, 1419-1424, 1vqn:0, 1419-1424, 1vqo:0, 1419-1424, 1vqp:0, 1419-1424, 1w2b:0, 1419-1424, 1yhq:0, 1419-1424, 1yi2:0, 1419-1424, 1yij:0, 1419-1424, 1yit:0, 1419-1424, 1yj9:0, 1419-1424, 1yjn:0, 1419-1424, 1yjw:0, 1419-1424, 2otj:0, 1419-1424, 2otl:0, 1419-1424, 2qa4:0, 1424-1429, 2qex:0, 1419-1424, 3cc2:0, 1419-1424, 3cc4:0, 1419-1424, 3cc7:0, 1419-1424, 3cce:0, 1419-1424, 3ccj:0, 1419-1424, 3ccl:0, 1419-1424, 3ccm:0, 1419-1424, 3ccq:0, 1419-1424, 3ccr:0, 1419-1424, 3ccs:0, 1419-1424, 3ccu:0, 1419-1424, 3ccv:0, 1419-1424, 3cd6:0, 1419-1424, 3cma:0, 1419-1424, 3cme:0, 1419-1424, 3cpw:0, 1419-1424
GAAC
1y69:9, 22-27, 1yl3:B, 25-30, 2b66:B, 25-30, 2b9n:B, 25-30, 2b9p:B, 25-30, 2hgq:B, 25-30, 2j01:B, 23-28, 2j03:B, 23-28, 2jl6:B, 23-28, 2jl8:B, 23-28, 2zjp:Z, 24-29, 2zjq:Y, 24-29, 2zjr:Y, 24-29, 3cf5:Z, 24-29, 3dll:Z, 24-29
GGGC
2vhm:B, 1315-1320, 2vhn:B, 1315-1320
GGGG
2vho:A, 921-926
UUAC
2ogm:0, 1991-1996, 2ogn:0, 1991-1996
UUAG
3bwp:A, 62-67, 3eog:A, 62-67, 3eoh:A, 62-67
UUCA
1njm:0, 2475-2480, 1njp:0, 2475-2480, 1vsa:w, 2573-2578, 1vsp:w, 2573-2578
UUUA
1ffk:0, 2431-2436, 1ffz:A, 457-462, 1fg0:A, 457-462, 1jj2:0, 2481-2486, 1k73:A, 2481-2486, 1k8a:A, 2481-2486, 1k9m:A, 2481-2486, 1kc8:A, 2481-2486, 1kd1:A, 2481-2486, 1kqs:0, 2481-2486, 1m1k:A, 2481-2486, 1m90:A, 2481-2486, 1n8r:A, 2481-2486, 1nji:A, 2481-2486, 1q7y:A, 2481-2486, 1q81:A, 2481-2486, 1q82:A, 2481-2486, 1q86:A, 2481-2486, 1qvf:0, 2481-2486, 1s1i:3, 2798-2803, 1s72:0, 2481-2486, 1vq6:0, 2481-2486, 1vq8:0, 2481-2486, 1vq9:0, 2481-2486, 1w2b:0, 2481-2486, 1yhq:0, 2481-2486, 1yi2:0, 2481-2486, 1yij:0, 2481-2486, 1yit:0, 2481-2486, 1yj9:0, 2481-2486, 1yjn:0, 2481-2486, 1yjw:0, 2481-2486, 2otj:0, 2481-2486, 2otl:0, 2481-2486, 2qa4:0, 2486-2491, 2qex:0, 2481-2486, 3cc2:0, 2481-2486, 3cc4:0, 2481-2486, 3cc7:0, 2481-2486, 3cce:0, 2481-2486, 3ccj:0, 2481-2486, 3ccl:0, 2481-2486, 3ccq:0, 2481-2486, 3ccr:0, 2481-2486, 3ccs:0, 2481-2486, 3ccu:0, 2481-2486, 3cpw:0, 2481-2486