Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 1674 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 201 structure(s)
Representative structure 1q81:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNN
Cluster members
ACA
1j5a:A, 1336-1340, 1jzx:A, 1336-1340, 1jzy:A, 1336-1340, 1jzz:A, 1336-1340, 1k01:A, 1336-1340, 2aar:0, 1328-1332, 2o43:A, 1328-1332, 2o44:A, 1328-1332, 2o45:A, 1325-1329, 2ogn:0, 1328-1332, 2zjp:X, 1306-1310, 2zjq:X, 1306-1310, 2zjr:X, 1303-1307, 3cf5:X, 1306-1310, 3dll:X, 1306-1310
ACG
1z58:2, 2545-2549, 2b66:A, 2592-2596, 2b9n:A, 2592-2596, 2b9p:A, 2592-2596, 2o45:A, 2554-2558, 2v47:A, 2547-2551
ACU
2vho:A, 333-337, 2vhp:A, 333-337
AGC
1i96:A, 1015-1019, 1p9x:0, 774-778, 1xbp:0, 2661-2665
AGG
1n34:A, 1432-1436, 2j00:W, 25-29, 3cun:D, 22-26
CAG
2oiu:Q, 41-45
CCG
1yl4:A, 176-180, 2v46:A, 208-212
CGU
1yl3:A, 404-408
CUC
1yl3:A, 2485-2489
CUU
1ffk:0, 2338-2342, 1fg0:A, 364-368, 1jj2:0, 2388-2392, 1k73:A, 2388-2392, 1k8a:A, 2388-2392, 1k9m:A, 2388-2392, 1kc8:A, 2388-2392, 1kd1:A, 2388-2392, 1kqs:0, 2388-2392, 1m1k:A, 2388-2392, 1m90:A, 2388-2392, 1n8r:A, 2388-2392, 1nji:A, 2388-2392, 1q7y:A, 2388-2392, 1q81:A, 2388-2392, 1q82:A, 2388-2392, 1q86:A, 2388-2392, 1qvf:0, 2388-2392, 1qvg:0, 2388-2392, 1s1i:3, 2705-2709, 1s72:0, 2388-2392, 1vq4:0, 2388-2392, 1vq5:0, 2388-2392, 1vq6:0, 2388-2392, 1vq7:0, 2388-2392, 1vq8:0, 2388-2392, 1vq9:0, 2388-2392, 1vqk:0, 2388-2392, 1vql:0, 2388-2392, 1vqm:0, 2388-2392, 1vqn:0, 2388-2392, 1vqo:0, 2388-2392, 1vqp:0, 2388-2392, 1yhq:0, 2388-2392, 1yi2:0, 2388-2392, 1yij:0, 2388-2392, 1yit:0, 2388-2392, 1yj9:0, 2388-2392, 1yjn:0, 2388-2392, 1yjw:0, 2388-2392, 2otj:0, 2388-2392, 2otl:0, 2388-2392, 2qa4:0, 2393-2397, 2qex:0, 2388-2392, 3cc2:0, 2388-2392, 3cc4:0, 2388-2392, 3cc7:0, 2388-2392, 3cce:0, 2388-2392, 3ccj:0, 2388-2392, 3ccl:0, 2388-2392, 3ccm:0, 2388-2392, 3ccq:0, 2388-2392, 3ccr:0, 2388-2392, 3ccs:0, 2388-2392, 3ccu:0, 2388-2392, 3ccv:0, 2388-2392, 3cd6:0, 2388-2392, 3cma:0, 2388-2392, 3cme:0, 2388-2392, 3cpw:0, 2388-2392
GAA
2qbi:B, 1365-1369
GAU
2o45:A, 355-359
GCA
2hgq:A, 1405-1409, 2hgu:A, 1405-1409, 2j01:A, 1331-1335, 2j03:A, 1331-1335, 2jl6:A, 1410-1414, 2jl8:A, 1410-1414, 3d5b:A, 1401-1405, 3d5d:A, 1401-1405
GCC
1n34:A, 1094-1098, 1n36:A, 901-905, 1njm:0, 2306-2310, 1njn:0, 2306-2310, 1njo:0, 2306-2310, 1njp:0, 2306-2310, 1pnu:0, 2350-2354, 1pny:0, 2350-2354, 1xbp:0, 2306-2310, 2b66:A, 2754-2758, 2b9n:A, 2754-2758, 2b9p:A, 2754-2758, 2f4v:A, 1094-1098, 2hhh:A, 1094-1098
GCG
2zjp:X, 1042-1046
GGA
1voq:A, 132-136, 1vos:A, 132-136, 1vov:A, 132-136, 1vox:A, 132-136, 1voz:A, 132-136, 1xbp:0, 1919-1923
GGC
2vho:A, 640-644
GGG
2v47:B, 80-84, 2v49:B, 80-84
GUA
2gyc:0, 1293-1297
GUG
1n34:A, 636-640
GUU
1q7y:B, 67-71, 1q81:B, 67-71, 2qa4:9, 67-71
UAU
1vou:B, 1119-1123, 1z58:2, 1376-1380
UCA
1xbp:0, 1045-1049, 2qbd:A, 1401-1405
UCC
1fjg:A, 1358-1362, 1hnw:A, 1358-1362, 1hnx:A, 1358-1362, 1hnz:A, 1358-1362, 1i94:A, 1361-1365, 1i95:A, 1361-1365, 1i96:A, 1361-1365, 1ibk:A, 1358-1362, 1ibl:A, 1358-1362, 1ibm:A, 1358-1362, 1j5e:A, 1358-1362, 1n32:A, 1358-1362, 1n33:A, 1358-1362, 1pns:A, 1374-1378, 1pnx:A, 1374-1378, 1s1h:A, 1359-1363, 1voq:A, 1374-1378, 1vos:A, 1374-1378, 1vov:A, 1374-1378, 1vox:A, 1374-1378, 1voz:A, 1374-1378, 1vs7:A, 1376-1380, 1xmo:A, 1352-1356, 1xmq:A, 1352-1356, 1xnq:A, 1352-1356, 1xnr:A, 1352-1356, 2aw7:A, 1376-1380, 2e5l:A, 1359-1363, 2f4v:A, 1358-1362, 2hhh:A, 1358-1362, 2i2p:A, 1376-1380, 2i2u:A, 1376-1380, 2qal:A, 1376-1380, 2qan:A, 1376-1380, 2qb9:A, 1376-1380, 2qbb:A, 1376-1380, 2qbd:A, 1376-1380, 2qbf:A, 1376-1380, 2qbh:A, 1376-1380, 2qbj:A, 1376-1380, 2qou:A, 1376-1380, 2qp0:A, 1376-1380, 2uu9:A, 1358-1362, 2uua:A, 1358-1362, 2uub:A, 1358-1362, 2uxb:A, 1358-1362, 2uxc:A, 1358-1362, 2uxd:A, 1336-1340, 2vhp:A, 1376-1380, 2vqe:A, 1358-1362, 2vqf:A, 1358-1362, 2z4k:A, 1376-1380, 2z4m:A, 1376-1380
UCG
1fyo:A, 4-8, 1fyp:A, 4-8
UCU
1nkw:0, 717-721, 1nwx:0, 717-721, 1nwy:0, 717-721, 1ond:0, 717-721, 1pnu:0, 717-721, 1pny:0, 717-721, 1y69:0, 717-721, 2zjp:X, 695-699
UGG
1n34:A, 1268-1272